Bioinformatica in Proteomics

Korte omschrijving

Er wordt stap-voor-stap uitleg gegeven over extensieve sequentie analyse, posttranslationale en chemische modificaties, en over structurele configuratie van proteïnen. Ook komen praktische toepassingen van bioinformatica tools aan bod.

Vanwege de snel toenemende hoeveelheid data in de Life Sciences, zijn software-oplossingen voor dataopslag en management een onontbeerlijk hulpmiddel voor onderzoekers geweest. Deze cursus biedt theoretische kennis en praktische ervaring in de nieuwste online bioinformatica tools. De cursus focust op proteomics onderzoek gebaseerd op massaspectrometrie, in het kader van peptide- en eiwitidentificatie, functionele analyse en data-sharing.

Tijdens de cursus neem je deel aan interactieve sessies, waarbij gebruik gemaakt wordt van een breed scala aan online bioinformatica tools. Je gaat aan de slag met ruwe data afgeleid van een op massaspectrometrie-gebaseerde analyse, om sequenties te identificeren, functies te bepalen en chemische wijzigingen te specificeren. Tijdens de cursus voer je  verschillende taken uit om volledig inzicht te krijgen in bioinformatica toepassingen voor proteomics. Case studies, praktische kenmerken en toepassingen van deze tools, komen hierbij aan bod.

Doelen

• Begrijpen en gebruiken van bioinformatica tools om proteomics data te analyseren.
• Browsen, ophalen en invoeren van proteomics data.
• Beoordelen van de sterke en zwakke punten van de bioinformatica-analysemethodes.

Doelgroep

Deze cursus is gericht op onderzoekswetenschappers van elke biologische discipline, laboratorium en klinisch personeel dat werkt met kwantitatieve analyses van peptiden en eiwitten, en op specialisten werkzaam in aanverwante vakgebieden. Cursisten wordt verzocht om hun eigen laptops mee te nemen om de interactieve taken tijdens de cursus uit te kunnen voeren.